Mega進(jìn)化樹(shù)主要用于進(jìn)化分析及分子鑒定功能的小工具,它是一款完全免費(fèi)的分子進(jìn)化遺傳分析軟件。通過(guò)它可以編輯序列的數(shù)據(jù)、進(jìn)行序列的比對(duì)、構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)和推測(cè)對(duì)比物種序列間的關(guān)聯(lián)。
Mega使用方法
1、打開(kāi)MEGA7.0軟件,熟悉MEGA7.0的版面
2、看到左上角的【Align】點(diǎn)擊選擇【Edit/Build Alignment】接下來(lái)會(huì)出現(xiàn)一個(gè)小窗口,點(diǎn)擊【OK】
3、點(diǎn)擊完【OK】又會(huì)彈出另一個(gè)小窗口,需要選擇protein 或者DNA,看自己需要,這里演示先選擇protein點(diǎn)擊之后出現(xiàn)窗口,之后操作在新窗口中進(jìn)行。
4、按圖中箭頭指示點(diǎn)擊【Edit】再選擇【Insert Sequence From File Ctrl+I】點(diǎn)擊之后在文件夾中選擇自己要改變的FASTA格式序列,選定之后打開(kāi)。
5、打開(kāi)序列我們會(huì)看到如下的小窗口,接下來(lái)在左上角選擇【Date】在子菜單中選擇【Export Alignment】【MEGA Format】
6、對(duì)剛才打開(kāi)的文件命名,選擇存儲(chǔ)位置,命名好之后點(diǎn)擊【保存】出現(xiàn)一個(gè)小窗口輸入和剛才一樣的名字進(jìn)去,點(diǎn)擊【OK】就好了,文件格式已轉(zhuǎn)換成功。
Mega特點(diǎn)
1、【編碼序列剖析】
系統(tǒng)發(fā)育推理
型號(hào)規(guī)格挑選
幽會(huì)和時(shí)鐘
祖?zhèn)髅胤絿?guó)家
挑選和檢測(cè)
序列比對(duì)
2、【統(tǒng)計(jì)分析方法】
最大似然
間距方式
一般最小二乘
較大 的簡(jiǎn)潔
復(fù)合型似然
貝葉斯算法
3、【強(qiáng)勁的視覺(jué)效果專(zhuān)用工具】
兩端對(duì)齊/追蹤在線編輯器
樹(shù)探索者
數(shù)據(jù)信息探索者
熱血傳奇發(fā)電機(jī)組
基因復(fù)制向?qū)?br />
時(shí)間樹(shù)向?qū)?br />
以上便是winwin7為大家?guī)?lái)的Mega進(jìn)化樹(shù)(分子進(jìn)化遺傳分析軟件)。